潘塔努自然保护区是大潘塔努地区的典型代表，这里有所有在潘塔努地区发生的生态发展生物进化形态。阿莫拉尔山的淡水湿地生态系统授予潘塔努自然保护区一种独特的自然景观。这里的生态环境是动态的、逐渐变化的。潘塔努自然保护区是潘塔努地区最重要的鱼类资源保护带，这里还有许多世界濒危物种。由于潘塔努自然保护区是干季离潘塔努地区唯一一块水源丰富的土地，因此而成为动植物避难的天堂。

潘塔努自然保护区由四部分组成，占地面积为 187818公顷。该遗址坐落于马托格罗索州（中巴西的西部）的西南角，是世界上最大的淡水湿地生态保护系统之一即巴西潘塔努地区的一小部分。库亚巴和巴拉圭河流是当地的两大河流，而这两条河流的源头正好位于这座遗址处。遗址中含有丰富的动植物群。

列入《世界遗产名录》的这部分保护区占地总面积为187818公顷，由4部分组成，保护区的海拔高度介于80米至900米之间，其中最高的是阿莫拉尔山脉。整个潘塔努地区一直延伸到邻国玻利维亚和巴拉圭，但是80%的领土依旧位于巴西境内。这个位于巴西西部的潘塔努是一片一望无际的冲积平原，跨越140000平方公里的土地。整个风景区中涵盖着各种各样的生态亚区，如河道走廊、林场、常年存在着的湿地和湖泊、季节性的泛滥平原和陆生森林。四周则为山脉和平原所环绕，在地形上是一个相对较平坦的风景区，只有沿着由南至北和由西至东的方向上有少许弯曲。

潘塔努作为一个单一的生物群系，至少由10个生物地理区组成，不同的土壤、植被和水文条件形成了不同的动物群落。潘塔努的动物群尤其丰富，包括80种哺乳动物、650种鸟类、50种爬行动物和400种鱼。受保护的动物群比较密集，诸如生活在当地的美洲虎，南美泽鹿、食蚁兽属和身躯庞大的水獭。这里还是许多喜好成群出现的各种鸟类的避难所，同时也是湿地类型鸟类的一个最重要的栖息家园。鹦鹉的种类也非常丰富，据记载，这里有26种鹦鹉，其中有一种叫金刚鹦鹉，是世界上最大的鹦鹉。

由于这些鹦鹉生活于树的顶端，这就给人们的观察带了诸多不便，但是近些年来，随着无线电传播技术的进一步发展，人们开始研究它们的行为和迁徙状况，这是非常有意义的，因为鸟类每天可以飞行25公里以上。动物生活环境的破坏和人类在这里进行的捕捉活动是引起这些动物趋于灭绝的两个主要因素。金刚鹦鹉最初的数量已难以估计，但是在上个世纪出现的某些鹦鹉种类已经消失，这一点是确信无疑的。

自然学家曾经报道，在他们去往巴西、玻利维亚和巴拉圭的一次探险旅途中，他们看见了数百只在这里早已经绝迹了的金刚鹦鹉。由于大量的捕捉活动和农业、放牧业的发展，鸟类的生存环境受到了威胁，其栖居范围日益缩减，因此每年都会有成千上万只鸟死去。